香港湿地公园一共分为访客中心和湿地保护区两大部份。

　　访客中心在建筑时引入不少环境保护的概念。如访客中心以原身混凝土建造，以减少油漆的使用，中心的上盖和外墙分别种以草坡及爬墙植物(异叶爬墙虎)，目的是可以隔热，从而减低使用空调所用的电能。另外，访客中心使用了地源热泵空调系统，将空调系统使用时所产生的热能散发在公园的储水池内。

　　访客中心内一共设有五个展览廊（依次为：湿地知多少、湿地世界、人类文化、观景廊及湿地挑战）。湿地世界内细分为三部份（北地苔原、热带沼泽、香港湿地），介绍不同地域的湿地生态。湿地向来与人类息息相关，人类文化便介绍湿地与人类发展的关系。湿地挑战则以互动游戏引领访客探索人类活动对全球湿地的威胁。除此之外，访客中心内亦设有介绍湿地的角色和功能的“湿地知多少”，以及可让访客欣赏和观察户外淡水沼泽的观景廊。在访客中心内也有商业地方，主要是大家乐快餐店和纪念品店。

　　湿地保护区分为溪畔漫游径，介绍溪流由上游至下游的生态；湿地探索中心，设有两个小型展馆，并定期有不同展览；生态探索区，溪流的缩影，可在此探索生态的奥秘；湿地工作间，展示湿地的农作物；演替之路，模拟荒废的湿地逐渐从开阔水域演变成林地的过程，并介绍生境与生物群落互相影响的关系；河畔观鸟屋、泥滩观鸟屋、鱼塘观鸟屋，这三大观鸟屋供游客观赏湿地公园的210种雀鸟；以及红树林浮桥、蝴蝶园和原野漫游径。分类详细，生态风景优美，难怪曾入选“香港十大胜景选举”第三名。